clustree—聚类可视化利器 / 开普饭

与传统的转录组测序相比,单细胞测序技术噪声很大,使得单细胞转录组数据包含大量的dropout事件(导致基因表达量为0或接近0),即使是一些标记(Marker)基因也有可能表达量很低.当在使用其对聚类的 ...

学习单细胞转录组肯定先来一遍Seurat官网的标准流程. 数据来源于Peripheral Blood Mononuclear Cells (PBMC),共2700个单细胞, Illumina Next ...

摘自:xuzhougeng https://www.jianshu.com/p/cf7a7341b0b6 目前该软件只支持Mouse和Human,不支持其他物种,因此不是这两个物种的小伙伴可以不用看了 ...

数据猿导读 <图说D3:数据可视化利器从入门到进阶>以一个故事开始,阐释制作可视化数据图表的基本方法论,以及如何结合D3 高效.快速地创建可视化图表. 作者:abby 数据.数据.数据.有 ...

原文链接:http://tecdat.cn/?p=5673 <第二十二条军规>是美国作家约瑟夫·海勒创作的长篇小说,该小说以第二次世界大战为背景,通过对驻扎在地中海一个名叫皮亚诺扎岛(此岛 ...

原文链接:http://tecdat.cn/?p=22838 本练习问题包括:使用R中的鸢尾花数据集 (a)部分:k-means聚类使用k-means聚类法将数据集聚成2组. 画一个图来显示聚类的 ...

原文链接: http://tecdat.cn/?p=20960 为了说明层次聚类技术和k-均值,我使用了了城市温度数据集,其中包括几个城市的月平均气温. 我们有15个城市,每月进行一次观测 boxpl ...

原文链接:http://tecdat.cn/?p=22879 数据集概述这个数据集常用于数据概述.可视化和聚类模型.它包括三个鸢尾花品种,每个品种有50个样本,以及一些属性.其中一个花种与其他两个花 ...

写在前面 PLS_DA 我在第一次使用的时候用于代谢组数据的区分,样本数量少,并且组件区分不是很明显.后来也就无所谓是什么数据了,作为一种降维方法,运用于什么组学倒是无所谓,只要找到我们需要的差异,也 ...

原文链接:http://tecdat.cn/?p=18770 为了用R来处理网络数据,我们使用婚礼数据集. > nflo=network(flo,directed=FALSE)> plot ...

小伙伴们早上好,今天给大家介绍一款新的图形,Excel中的四象限图,如下图所示,横坐标代表武力大小,纵坐标表示颜值高低,每一个四边形(点)表示一个英雄. 如果按60算作为中间线,将界面分为四个组成部分 ...

原文链接:http://tecdat.cn/?p=23825 简介本文介绍了基于有限正态混合模型在r软件中的实现,用于基于模型的聚类.分类和密度估计.提供了通过EM算法对具有各种协方差结构的正态混合 ...

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