中文版GEO数据库来了！ / 开普饭

关于表达芯片的公共数据库挖掘我这边以及差不多把改写的推文在2年前就写完了,但表达芯片毕竟只占芯片市场的半壁江山,还有大量的非表达芯片,比如大名鼎鼎的甲基化芯片.关于甲基化,我们公众号教程非常少,主要是 ...

数据库技术是研究.管理和应用数据库的一门软件科学.通过研究数据库的结构.存储.设计.管理和应用的基本理论和实现方法,对数据库中的数据进行处理和分析. 本文我们将介绍几种数据库和数据挖掘技术,帮助临床研 ...

前两天我们对GEO数据库来了一个大致的介绍GEO数据集详细介绍GEO数据库介绍 (一).我们对于目标数据集,我们做的第一个事情就是差异分析,来寻找有差异的结果.所有的表达芯片做的差异表达分析都 ...

研究背景: 肺腺癌(LAD)是最普遍的肺癌类型.据报道,UDP-N-乙酰氨基葡糖焦磷酸化酶1(UAP1)的异常表达与癌细胞的许多生物学过程有关,但尚不清楚LAD中UAP1的表达. 研究方法: 生物信息 ...

#GEO是什么? GEO全称Gene Expression Omnibus data base,由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库(通过NCBI首页,All Database ...

利用一周多的时间,我们把最最基本的生信套路来讲解了一遍.正好前几天一个小伙伴拿了一篇相关文献在咨询问题.这里就拿这篇文献来总结一下我们目前写的这些东西. 这次我们来讲解的这边文献是2019-10-12 ...

随着高通量测序技术的迅猛发展,各种生物医学数据库应运而生,大数据挖掘技术已成为生物医学领域中最新最重要驱动力之一.GEO是当今最大.最全的公共基因数据资源库,包括基因的表达.突变.修饰等信息,涵盖几乎 ...

没有样本,没钱测序,如何拿别人的数据来发自己的文章呢? 公共数据库挖掘呀! 众所周知,TCGA和GEO是最著名的两大公共数据库,前者主要存储高通量(二代测序)数据的肿瘤样本数据(TCGA的0代码可视化 ...

GEO数据库全称GENE EXPRESSION OMNIBUS,是由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库.它创建于2000年,收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据,也就 ...

在第一讲我们详细介绍了GEO数据库的基础知识及规律,也了解了如何利用官方R包GEOquery来探索GEO数据库,当然,我的生信菜鸟团博客里面也从很多其它角度解析过它,欢迎大家自行搜索学习.总得来说,从 ...

耗费半年的时间精心制作了成套的生物信息学入门视频教程,并且在生信技能树联盟平台发布了这个长达74个小时全套生物信息学入门视频:生信技能树视频课程学习路径,这么好的视频还免费! 在B站看了看,大家学的热 ...

接收到太多的粉丝求助,想下载个表达矩阵做一下数据挖掘偏偏第一步就卡在了,数据文件下载半天毫无动静,或者下载到99%就卡死了.如果我恰好在电脑旁,通常会帮忙下载后微云或者百度云传递给粉丝,但这毕竟不是长 ...

最近还是大量粉丝留言表示自己因为疫情困在家里,想做数据挖掘混个本科毕业论文,但是看完我的GEO数据挖掘视频后,想下载个数据集,就被卡死了,实在是巧妇难为无米之炊! 这个不怪大家,我给大家的免费的GEO ...

最近在读AUCell包的文档,链接是:http://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/AUCell.html,这个包的教程我已经写完了, 在 :使 ...

师兄的文章要送审,编辑让把RNA-seq的数据传到GEO数据库上,今天就在传这个数据. 之前没传过数据,今天就是一边学一边搞这个. 一.注册账号先注册一个GEO账号二.准备工作选择Data ty ...

不知不觉在单细胞转录组领域做知识分析也快两年了,很幸运聚集了一些小伙伴携手共进,我们承诺不间断更新5个月,把我们这两年的学习成果全部掏出来给大家,希望大家都能有所收获!当然也欢迎大家加入我们,勇于分享 ...

中文版GEO数据库来了！