插件FastQC | 点点点，人人看看测序数据质量 / 开普饭

咱们<生信技能树>的B站有一个ChIP-seq数据分析实战视频课程,缺乏配套笔记.恰好前些天的求贤令:曾经我给你带来了十万用户,但现在祝你倒闭,走大运结识了几位优秀小伙伴! 其中中国医科大 ...

对原始测序fq文件数据进行质量控制任务了解fastq测序数据需要用安装好的sratoolkit把sra文件转换为fastq格式的测序文件,并且用fastqc软件测试测序文件的质量! 作业,理解测 ...

NGS数据分析实践:05. 测序数据的基本质控 [1] - FastQC 目录前言 1. FastQC 1.1 帮助信息及运行代码 1.2 报告解读 1.3 小结文接上篇:NGS数据分析实践:04 ...

质控之前我们在直播八的时候分析过,公司也给了我质控后的的数据,但是毕竟是别人做的,我们做为一个数据分析师,自己动手来验证一下公司给出的报告也是再好不过的了.大家可以跟着我先将下载数据进行一下质控. 因 ...

咱们<生信技能树>的B站有一个lncRNA数据分析实战,缺乏配套笔记,所以我们安排了100个lncRNA组装案例文献分享,以及这个流程会用到的100个软件的实战笔记教程! 下面是100个l ...

书籍翻译好的书籍是人类进步的阶梯,但有些人却找不到优秀的阶梯,为此我们开设了书籍翻译这个栏目,作为你学习之路的指路明灯:分享国内外优秀书籍,弘扬分享精神,做一个知识的传播者. 希望大家能有所收获! ...

NGS数据分析实践:05. 测序数据的基本质控 [2] - MultiQC 目录 2. MultiQC 2.1 帮助信息及运行代码 2.2 报告解读 2.3 小结文接上篇:NGS数据分析实践:05. ...

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读本系列的上一篇推文,即"开篇"中已经描述了宏基因组研究的基本思路和方法.先回顾一下,首先是收集样 ...

写在前面 2020 年 07 月末,我立了 flag,提出通过写一系列的TBtools插件,进而让所有人(在笔记本上)完成常规的(非上百套数据)公开可获取的转录组数据分析. 转眼,约莫一个月就过去了. ...

由于我是分期付款,所以我先拿到了我的测序数据的质控结果和比对情况分析报告,需要补齐全款后才能拿到原始测序数据!(中间还出了个小意外,打款的时候不小心多打了30块钱!(⊙o⊙)-不过多打的30块钱想拿回 ...

本文由Bayegy根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读明明测了100000条序列,为什么我用dada2得到的OTU丰度只有8000?是人性的扭曲还是道德的沦丧? ...

普通小麦是一个由三个密切相关的亚基因(AABBDD)组成的异源六倍体.它被认为起源于两次多倍化事件:第一次是野生四倍体小麦(AA)与未发现的节节麦谱系(BB)杂交形成的四倍体,距今约50万年;第二次是 ...

上周三(7月26日),诸葛io创始人&CEO孔淼受邀出席了AWS技术峰会2017,本届峰会围绕多项云计算热门议题,覆盖大数据和人工智能.架构.安全.IOT等十大技术分会场,汇集众多技术团队的大 ...

编译:夕夕,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读目的:系统红斑狼疮是(SLE)是一种异质性自身免疫性疾病,治疗困难.目前SLE患者没有最佳分类.因此,患者对于现有治疗反映是不可预测的 ...

推荐:江舜尧编译:多儿编辑:马莉费城儿童医院学者Kai Tan等人于2019年5月7日在<Genome Biology>上发表题目为<SCRABBLE: single-cell ...

一.成果短讯: 2018年8月31日,英国癌症研究所进化与癌症中心的Giulio Caravagna的研究团队在国际期刊Nature Methods 发表了题为"Detecting repe ...

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