HiC数据辅组基因组组装之Lachesis / 开普饭

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我们的课程走到第四步,许多朋友都卡在了Scoop这个工具,遇到不能上Google的报错.本文将来解决此问题,考虑可能出现的多种报错,教程会有些啰嗦,但能确保你即使不上Google,就能成功装上Scoo ...

一. 搭建目标基于Windows10家庭版,以及自带的Ubuntu子系统,搭建linux开发环境以及dokcer运行环境,并实现Ubuntu和Windows环境间的相互通信.预计搭建时长1到2h左右 ...

牛瘤胃微生物组的参考基因组集用于瘤胃微生物组生物学和酶发现的4,941个瘤胃宏基因组组装基因组集 Compendium of 4,941 rumen metagenome-assembled gen ...

为进一步提高<微生物组实验手册>稿件质量,本项目新增大众评审环节.文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见.公众号格式显示略有问题,建议电脑端点击文末阅 ...

普通小麦是一个由三个密切相关的亚基因(AABBDD)组成的异源六倍体.它被认为起源于两次多倍化事件:第一次是野生四倍体小麦(AA)与未发现的节节麦谱系(BB)杂交形成的四倍体,距今约50万年;第二次是 ...

对人和鼠科研项目来说,各种NGS测序数据分析起来都是有成熟的流程和工具,但是并不是使用的物种都是有参考基因组和注释文件的,走流程的前提就需要先测定自己研究的物种的基因组,组装起来. 比如最近有粉丝咨询 ...

可能基本上没有多少<生信技能树>的粉丝知道,其实我的生物信息学技能也是从基因组组装开始的,大概是八九年前我本科还没有毕业就去北京实习,在西四环的青塔那边的水产所跟着大黄鱼等基因组团队做一些 ...

最近有一些朋友咨询新物种的基因组组装相关数据分析,我其实是七年前有参与过一点点啦,是大黄鱼等基因组,好像还是什么973项目,那个时候基因组都是cns级别文章.但是自从离开北京后一直做的都是人类疾病,尤 ...

有学员问10x的3'端测序来infer CNV 是否可靠? 这个问题,说实话,很难回答,因为要是能完整回答这个问题,其实就是一篇正经的生物信息学文章了. 而且以前的确有文章这样做,我看到过的文章是是 ...

关键词:零基础:叶绿体基因组:神器:国人佳作:一键成环. 软件官网:https://github.com/Kinggerm/GetOrganelle GetOrganelle 这款软件是建军和郁文彬老 ...

随着高精度长读长测序技术的出现,基因组难以组装的状态正在改变.<Nature Methods>杂志上近日发表了一篇文章,介绍了基因组组装项目如何受益于这种技术. E. Dewalt/T. ...

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