是否可以根据10X转录组数据来推断基因组CNV信息呢？ / 开普饭

Bulk RNA-seq 和single cell RNA-seq的最主要区别在于单细胞测序代表单个细胞(single cell),而bulk测序代表一群细胞(a population of cell ...

单细胞转录组测序技术可以帮助揭示机体细胞功能和分子调控机制,改变了人们对独特细胞类型和信号通路的理解,对于机体的生长发育和疾病研究有着重要作用.具体来说,scRNA-seq在生长发育研究中的应用方向大 ...

近日,世界卫生组织国际癌症研究机构(IARC)发布了2020年最新癌症负担数据,全球新发病例1930万.死亡近1000万例,而中国更是达到了新发457万/死亡300万.病死率超过60%的恐怖数字,这使 ...

本期我们通过PubMed数据库检索,整理了从2021年8月1日到8月31单细胞技术文章共764篇.其中IF (影响因子)大于9分的文章有216篇(文章后面使用表格列出),现选择其中20篇代表性文章进行 ...

生信实操随着测序技术的进步开发了一种单细胞转录组测序(scRNA-seq)技术,单细胞转录组测序技术可以一次检测成千上万个细胞的转录水平,在单细胞水平上检测和定量基因表达水平变化,从而揭示bulk ...

第一章单细胞科研:第二节,单细胞技术介绍 ##文章亮点 ### 1 Drop-seq可通过RNA-seq高度并行地分析单个细胞 ### 2Drop-seq与DNA条形码的珠子一起将细胞包裹在纳升的液 ...

Single-cell RNA-seq enables comprehensive tumour and immune cell profiling in primary breast cancer利 ...

总是有粉丝在我们的各个公众号教程下面留言关于单细胞数据处理的细节问题,比如为什么我们过滤线粒体基因表达量超15%的细胞啊,为什么看核糖体基因表达量占比啊等等. 其实看一下基础10讲: 01. 上游分析 ...

冷知识:其实一个10X单细胞转录组样品可以有多达84个fastq文件哦! 我们在单细胞天地多次分享过cellranger流程的笔记,大家可以自行前往学习,如下: 单细胞实战(一)数据下载单细胞实战( ...

10x Genomics方法巧妙使用了Barcoding(条形码)和Microfluidics(微流体)技术,在单细胞分离.扩增原理上具有明显的优势,能帮助研究人员实现对细胞群体的划分与细胞群体间基因 ...

未知的东西总是让人害怕,即使是花时间看他人做过一遍也好过踟蹰不前,请看好: 首先需要10x仪器出来的fastq数据这个可以看前面的教程:10X genomics单细胞数据集探索列出了非常多的官网教 ...

软件项目地址: https://github.com/broadinstitute/inferCNV.git 我在 https://mp.weixin.qq.com/s/Qns9TCSgNg_CQuw ...

前面我们介绍了单细胞转录组表达矩阵可以推断CNV的文献出处及历史,也简单过了一半broad开发的inferCNV软件,但是只运行了其测试数据,远远不够.单细胞转录组数据分析CNV使用broad出品的i ...

前面我们介绍了单细胞转录组表达矩阵可以推断CNV的文献出处及历史,也简单过了broad开发的inferCNV软件,在其提供的测试数据上面成功运行了,也测试了airway这个转录组数据,但是效果不好,现 ...

我的课题只有一个10x样本肿么办? 两个样品的10x单细胞转录组数据分析策略三个10X单细胞转录组样本CCA整合多个单细胞转录组样本的数据整合之CCA-Seurat包在教程:使用seurat3的 ...

普通小麦是一个由三个密切相关的亚基因(AABBDD)组成的异源六倍体.它被认为起源于两次多倍化事件:第一次是野生四倍体小麦(AA)与未发现的节节麦谱系(BB)杂交形成的四倍体,距今约50万年;第二次是 ...

是否可以根据10X转录组数据来推断基因组CNV信息呢？