Bioconductor 分析芯片数据教程 / 开普饭

根据2期SPEARHEAD-1试验的数据,实验性工程T细胞受体疗法Afamitresgene autoleucel(afami-cel,以前为ADP-A2M4)在曾经接受多种治疗的晚期滑膜肉瘤或粘液样 ...

在文献 J Natl Cancer Inst. 2018 Jul :题目是:Intratumor Heterogeneity of the Estrogen Receptor and the Long ...

事情总不会一直顺风顺水,如果有人带你,学习当然舒服,明天我们会发布学徒招募,敬请期待! 装一点沙子,填你挖的坑最近收到网友求助,问: 尝试一篇文献的表达差异分析和热图重现,主要参考您Github中G ...

首先交代一下用来说明这几个统计量的例子.这里会使用基因表达作为一个例子.假设我们有两组细胞:对照组和处理组.我们正在研究基因 A 在处理的条件下是否受到表达或没有表达.每组我们有 12 个重复.我们通 ...

表达芯片数据处理教程,早在2016年我就系统性整理了发布在生信菜鸟团博客:http://www.bio-info-trainee.com/2087.html 配套教学视频在B站:https://www ...

最近很多小伙伴表示,在使用R语言下载GEO数据集,或者其它文件,会遇到时间不够的情况,比如如下所示的报错: In download.file(url, destfile, method, mode = ...

作者是生信技能树组建的表观遗传学学习小组的小组长,前面已经发过一个: 学员分享-Chip-seq 实战分析流程本文是看到生信技能树有个450K甲基化芯片数据处理传送门,我呢,恰好不久前用一个集成度很 ...

本讲涉及到的芯片分别是: GSE7762 GSE62346 GSE50382 视频里的示例会带领大家使用 GEOquery 包里面的getGEO函数下载每个表达芯片数据在GEO数据库里面的数据,解析获 ...

早在我们举办甲基化芯片专题学习的时候,见: 450K甲基化芯片数据处理传送门就有非常棒的一站式教程投稿,也因此我结识了优秀的六六,以及其教程大力推荐的R包作者,见: 850K甲基化芯片数据的分析但 ...

我这里先列出学徒作业,大家需求下载头颈癌里面的口腔癌的甲基化芯片信号值矩阵,然后挑选有N-T配对的32个病人的数据进行差异分析,就走我们介绍的champ流程即可! 理论上你掌握了这个分析策略,换成任何 ...

写文章是给人看的,文章有人看,看的人多,自己写起来就更有劲,更有动力. 那么,哪些人读过你的文章?有多少人对你的文章感兴趣?你的文章传播效果如何?了解这些问题,对于写作者来说,是件非常重要的事. 在传 ...

一.5月14日热点前瞻热点一:国产芯片逻辑概述:13日晚中芯国际发布一季度财务数据,营收同比增长35.3%,创历史新高.公司决定将2020年资本开支进一步上调至43亿美元,以充分满足市场需求. 相 ...

文章来源于公众号:智药邦药物临床试验的进展很大程度受限于受试者招募的进展,受试者招募的进展与入组标准密切相关. Nature杂志4月的一篇文章,介绍了AI在简化临床试验入组标准方面的价值和应用. 临 ...

原文链接:http://tecdat.cn/?p=22302 混合效应逻辑回归用于建立二元结果变量的模型,其中,当数据被分组或同时存在固定和随机效应时,结果的对数几率被建模为预测变量的线性组合. 混合 ...

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