关于批次效应矫正后出现负值 / 开普饭

浅析单因素方差分析中的多重比较本脚本侧重于单因素方差分析中多重比较方法的运用; 就不展示数据正态性及齐次性的运算了(默认都符合,一般理化数据是都符合的); 有的人喜欢用Tukey检验,但会遇到一些不 ...

R学习往期回顾: R学习:R for Data Science(六)使用forcats处理因子 R学习从Tidyverse学起,入门R语言 dplyr合并数据 R学习流程控制 if,else,if ...

写在前面有时候我们展示的指标有一定的关系,希望可以使用堆叠柱状图展示.许多朋友们问询,这样如何添加显著性标记,因此本期结合EasyStat包给大家做一个演示. R 包导入 ## 导入包 librar ...

年底了,各种事情都在排队去做,造成的后果就是时间像流水一下迅速过去了,抽出一点时间做点学习成了奢求,前两天在微生信生物群0中讨论了一个如何对堆叠柱状图添加误差线问题,类似下面的图片:额.画质真烂!我使 ...

python虽然与R一样都可以做数据分析,但是在计量方面较为薄弱,python更像是干脏活,清洗数据用的.现在慢慢的python也有一些在计量的包,比如causalinference,这个包可以做因果 ...

R学习往期回顾: R学习:R for Data Science 循环-迭代(for while)) R学习:R for Data Science 向量(1) R学习:R for Data Scienc ...

原文链接:http://tecdat.cn/?p=22181 本文考虑一下基于核方法进行分类预测.注意,在这里,我们不使用标准逻辑回归,它是参数模型. 非参数方法用于函数估计的非参数方法大致上有三种 ...

浅析R语言多组定量资料非参数检验的多组比较及簇状柱形图显著性字母标记之分面与分组的图形艺术 R语言多组定量资料非参数检验的多组比较非参数检验的应用本流程是在刘永鑫老师提供的代码资料指导下完成先简 ...

最近接到粉丝求助,他最近在跟着我B站课程和GitHub代码处理GEO 芯片: GSE113486 GEO平台已经进行了log2 转换和 Normalized signal intensity by ...

前段时间,我们对于批次效应有关的东西进行了一些介绍.其中包括 [[批次效应]] [[批次效应去除工具]] 对于经常使用的TCGA数据库而言,同样也有批次效应存在.对于这样的批次,在公布之前也经过一定的 ...

又一次被迫讨论这个让人又爱又恨的批次效应了,主要是因为上一个教程不同癌症的差异难道大于其与正常对照差异吗:大家的留言: 我们这一次的主题就是探索不同癌症的正常对照,有没有可能通过去除批次效应 ...

推荐:江舜尧编译:卓求编辑:十九伦敦玛丽女王大学威廉·哈维研究中心David William Randall教授等人于2019年9月2日在Microbiome发表题目为<Batch eff ...

一般情况下我们最好是在实验设计上就考虑到这一点. 但很多时候,数据分析者往往身不由己. Stanford 大学在MOOC上面的公开课:PH525x series - Biomedical Data ...

前面我在生信技能树推文:你确定你的差异基因找对了吗? 提出了文章的转录组数据的60个样品并没有按照毒品上瘾与否这个表型来区分,而是不同人之间的异质性非常高,这个时候我提出来了一个解决方案,就是理论上就 ...

写教程的话,我的优点仅仅是量大,坚持了七年多写了超1万篇教程.但实际上绝大部分都浮于表面,深度不够. 恰好最近看到了一个超级优秀的博客,安排了其中几篇给学徒们翻译和理解,超级值得读! 阅读前面的翻译稿 ...

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最近有粉丝咨询我多个gsea数据集整合时候的批次效应的处理,我看了看,有affymetrix,agilent,illumina的芯片数据,还有测序的转录组,我勒个去,感觉是在集邮一样,然后邮件附上了一 ...

关于批次效应矫正后出现负值