可以使用Aspera从CNGBdb数据库高速下载fastq测序数据啦 / 开普饭

[数据库]SRA数据库介绍及数据下载 - 目录 1. SRA数据库介绍 (1) SRP开头的ID:PRJNA = SRP (2) PRJNA开头的ID:SAMN = SRS (3) SRX开头的ID ...

bowtie2 语法很重要!!!! Usage: bowtie2 [options]* -x <index> {-1 <m1> -2 <m2> | -U <r ...

原文见:使用aspera从EBI下载fastq数据,抛弃NCBI的SRA数据库吧! 其它sra数据库见: 不止是NCBI的SRA可以下载测序数据下载sra数据库文件不仅仅是prefetch那么简单了 ...

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 DDBJ(DNA Data Bank of Japan)是与NCBI的GenBank,EMBL的EBI数据库齐名的世 ...

四年前我写过介绍GEO和SRA数据库的推文 : 解读GEO数据存放规律及下载,一文就够解读SRA数据库规律一文就够其实就是耗费一点时间去摸索如何在这两个数据库里面查询下载自己感兴趣的文章的数据.注 ...

当然,这种情况实属罕见,一般来说这种情况说明你的fastq测序数据在传输压缩解压过程中出现了不可描述的错误. 当然,你可以先判断一下自己的fastq是什么规格的编码方式: zcat clean.1.f ...

SRA文件的解压主要是用sratools中的fastq,但是这个软件不能多线程运行,随着测序数据越来越大,fastq的解压速度可能成为整个流程的瓶颈(其实并不会:P,不过没有多线程就是不爽). 不过s ...

前面我们大量NGS相关教程视频免费发布在B站,都是使用NCBI的SRA数据库下载sra文件后转为fastq进行NGS分析流程,其实是因为我本人一直不在中国大陆,所以没有网络问题.但是学生们不一样,同样 ...

当我们需要一些NGS数据时,一般会去NCBI或者EBI的数据库中下载.但是当我们用wget下载时,时常会出现断开连接或者网络下载速度缓慢,对于几十G或者上百G的数据,下载无计可施,这是则可以使用Asp ...

〇.前言百度网盘作为目前国内最大的网盘平台,可谓垄断了国内的文件分享和资源下载市场,大家的工作学习都经常中碰到百度网盘分享的链接. 然而,一家独大的后果就是臭名昭著的「非会员限速」,网友调侃就算是快 ...

[PConline 应用]迅雷11来了,这次来了个界面大瘦身,而且还加上了一个神秘的新功能,另外据不少参与测试的网友反映,非会员用户在迅雷11中的下载速度也不错,那么赶紧一起跟着小编体验一下吧. 界面 ...

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