使用TCGA数据随机抽取基因形成虚拟panel计算TMB / 开普饭

If you want to win a race or stick to a difficult diet, coaches of all kinds will tell you it's all ...

转自:程凉皮儿:https://www.jianshu.com/p/7b02459defedmaftools_2clp02 June, 2020maftools : 总结.分析.可视化 MAF文件ma ...

使用 XENA下载的TCGA-LAML.mutect2_snv.tsv文件绘制基因词云和突变景观图. 一基因词云有小伙伴在https://mp.weixin.qq.com/s/DvX_pKPF9b ...

欢迎来到医科研,这里是白介素2的读书笔记,跟我一起聊临床与科研的故事, 生物医学数据挖掘,R语言,TCGA.GEO, SEER数据挖掘. Cancer-related Data Resources A ...

测序上游分析系列: mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵:上中游分析pipeline miRNA-seq小RNA高通量测序pipeline:从raw reads,鉴定已知miR ...

A massive study of nearly 4,000 variants in a gene associated with cancer could help to pinpoint pe ...

欢迎来到医科研,这里是白介素2的读书笔记,跟我一起聊临床与科研的故事, 生物医学数据挖掘,R语言,TCGA.GEO, SEER数据挖掘. 2020年3月美国马里兰州巴尔的约翰霍普金斯大学彭博公共卫生学 ...

这两天"王院长"帮别人分析snv数据,顺便给我推荐了一个R包:maftools.我看了一下官网,感觉是个非常强大的R包.那必须要学习起来~实际上网上已经有很多教程了,但都是用maf ...

我们在利用WPS表格和Excel表格进行日常办公时,经常会给我们的工作带来极大的便利,如果在公司年会时,我们需要在众多的人员名单里,随机选出三位一等奖,该如何做呢,之前我们为大家介绍了 ...

Excel情报局 Excel职场联盟生产搬运分享Excel基础技能 Excel爱好者大本营用1%的Excel基础搞定99%的职场问题做一个超级实用的Excel公众号 Excel是门手艺玩转需要勇 ...

"安慰剂"(placebo)一词来自医学上的随机实验,比如要检验某种新药的疗效.此时,可将参加实验的人群随机分为两组,其中一组为实验组,服用真药:而另一组为控制组,服用安慰剂(比如 ...

本文编译自Nature Communications 美国芝加哥大学遗传医学部和人类遗传学系的Yang I. Li等于2019年3月1日在<Nat Commun>上发表题目<Prio ...

PPP项目的采购结果确认谈判,采取随机抽取方式确定谈判顺序合法吗? 岳小川:<政府和社会资本合作项目政府采购管理办法>(财库[2014]215号)第十五条规定,"采 ...

不知道大家做生信分析的时候,有没有遇到做差异分析的时候没有得到一个差异基因的情况,反正笔者遇到过好几次,无论是GEO数据还是别人给的测序数据都遇到过没有差异基因,哪怕是使用最低的过滤标准都遇到过. 现 ...

之前对TCGA做了简单的了解,粗略了解了什么是TCGA,TCGA是做什么的等,接下来肯定是要学会如何下载TCGA数据,毕竟只有下载了数据才能继续学习官网常规下载 TCGA自2016年改版后,下载方式 ...

不知道为什么总是有人问我TCGA数据下载这么简单的问题,这问题简单到如何下载人类的hg19.fa这个参考基因组一下,就是http://hgdownload.cse.ucsc.edu/goldenpat ...

背景介绍如果是bulk RNA-seq,那么现在最流行的就是DESeq2 和 edgeR啦,而且有很多经过了RT-qPCR 验证过的真实测序数据可以来评价不同的差异基因算法的表现. 对单细胞测序数据 ...

使用TCGA数据随机抽取基因形成虚拟panel计算TMB