多分组的甲基化差异分析之QDMR / 开普饭

. 数字生命健康产业创新服务基因慧 [导语]目前较常使用的DNA甲基化检测方法大都需要BS(重亚硫酸氢盐)处理,该技术容易导致绝大多数DNA分子发生断链.本文主要对甲基化文库构建过程中BS处理方案和 ...

关于RRBS 简化甲基化测序(Reduced Representation Bisulfite Sequencing,RRBS)是利用限制性内切酶对基因组进行酶切,富集启动子及CpG岛等重要的表观调控 ...

据世界卫生组织国际癌症研究机构(IARC)发布的2020年全球最新癌症负担数据显示,2020年全球新发癌症病例 1929万例,死亡病例996万例,中国癌症死亡人数位居全球第一.统计发现,癌症临床期早期 ...

WGBS跟RRBS如何选择?表观DNA甲基化和转录调控结果关联思路前几天,易基因推送了以RRBS技术研究结果高分见刊的SCI文章[详见:Mol Biol Evol:利用RRBS技术多维度分析人和小鼠 ...

问题的提出近年来单细胞测序真是火得一塌糊涂,易基因作为行业较早开展单细胞甲基化测序科研服务的企业,我们也接到了不少老师在数据分析方面的求助.在BS数据分析中,最常用的比对工具就是BSMAP和bism ...

Early epigenetic changes of Alzheimer's disease in the human hippocampus人类海马体中阿尔茨海默氏病的早期表观遗传变化一.研究背 ...

通过前面的讲解,我们顺利的了解了GEO数据库以及如何下载其数据,得到我们想要的表达矩阵,也成功的使用了GSEA这个分析套路. 历史目录: 解读GEO数据存放规律及下载,一文就够解读SRA数据库规律一 ...

转眼间2021都过去了快三分之一,我们的明码标价专栏建设的进度条却纹丝不动,感觉略微有点尴尬,得加油啦!根据大家在我们<生信技能树>,<生信菜鸟团>以及<单细胞天地> ...

写在前面今天是2020年10月6日,这几天都很忙碌,许多批次的数据需要再次分析和进一步分析,许多材料需要赶出来,百忙之中还有几位同学的婚礼,确实非南京很难到场,这里祝愿这几位百年好合,早生贵子.国庆 ...

我们阅读量破万的综述:RNA-seq这十年(3万字长文综述) 给粉丝朋友们带来了很多理解上的挑战,所以我们开辟专栏慢慢介绍其中的一些概念性的问题,上一期: 箱线图的生物学含义这一讲我们来说一下lim ...

大家学习到的我以前的教程,通常是两个组的样本进行差异分析,然后走标准分析流程,火山图,热图,GO/KEGG数据库注释等等.表达芯片数据处理教程,早在2016年我就系统性整理了发布在生信菜鸟团博客:ht ...

大家学习到的通常是两个组的样本进行差异分析,然后走标准分析流程,火山图,热图,GO/KEGG数据库注释等等.这些流程的视频教程都在B站和GitHub了,目录如下: 第一讲:GEO,表达芯片与R 第二讲 ...

甲基化的一些基础知识甲基化芯片的一般分析流程有意思的是,甲基化分析其实和普通的mRNA表达矩阵分析有很多概念问题是无法迁移的,包括质量控制,WGCNA分析,哪怕是简单的差异分析都有区别. 标准差异 ...

差异分析永远是最平易近人的策略,我们前面整理的各种系列教程,miRNA的,lncRNA的,mRNA芯片或者测序,circRNA系列的,都会得到表达矩阵,然后走差异分析.只不过是不同统计学分布的表达矩阵 ...

前面我们介绍了一些背景知识,主要是理解什么是DNA甲基化,为什么要检测它,以及芯片和测序两个方向的DNA甲基化检测技术.具体介绍在:甲基化的一些基础知识,也了解了甲基化芯片的一般分析流程 . 但是我留 ...

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