下载TCGA所有癌症的maf文件做signature分析 / 开普饭

转自:程凉皮儿:https://www.jianshu.com/p/7b02459defedmaftools_2clp02 June, 2020maftools : 总结.分析.可视化 MAF文件ma ...

前言交代 1.学习参考之前参加了生信技能树花花老师的TCGA数据挖掘试讲课,收获很多,最近整理一下上课笔记,同时参考了老师的简书相关教程.生信入门的朋友也可微信加入生信星球公众号,个人觉得很好的一个 ...

这两天"王院长"帮别人分析snv数据,顺便给我推荐了一个R包:maftools.我看了一下官网,感觉是个非常强大的R包.那必须要学习起来~实际上网上已经有很多教程了,但都是用maf ...

明白什么是TMBTMB (Tumor mutation burden)的定义:癌症样本全基因组中去除胚系DNA变异后体细胞突变数目.比如Lawrence,MS团队在Nature上发表的研究中,将超过1 ...

长期更新列表: 使用R语言的cgdsr包获取TCGA数据(cBioPortal)TCGA的28篇教程- 使用R语言的RTCGA包获取TCGA数据 (离线打包版本)TCGA的28篇教程- 使用R语言的R ...

半年前我就系统性的介绍过:TCGA的pan-caner资料大全(以后挖掘TCGA数据库就用它) 还专门指出了癌症的somatic突变的maf文件问题:TCGA数据库maf突变资料官方大全但是最近收到 ...

提到癌症,人人都害怕,闻之色变! 不过,人人都怕癌症,但癌症也有"怕"的东西,听听它的自述! 癌细胞的自述:癌症是你自己招来的 "不要再责怪我了,因为很大程度上,正是你们 ...

5月20日,贝壳官方发布讣告称,贝壳创始人.董事长左晖因疾病意外恶化去世,年仅50岁. 左晖刚刚登顶中国地产业首富,其身价超2220亿元,超过了许家印.杨惠妍.王健林等一众传统地产大佬,被誉为&quo ...

2 月4 日是" 世界癌症日",不幸的是,在今年"世界癌症日"的前一天(2 月3 日)43 岁的音乐人赵英俊因癌症去世. 2020 年12 月15 日, 世界卫 ...

小九有一位朋友,他思路清奇,经常向我提出一些奇奇怪怪的问题,比如: 口吃的人打嗝,是不是也会口吃? 为什么口水离开嘴巴后那么臭? -- 人睡不着时,就会开始胡思乱想,昨天晚上,这位朋友又向我提出了一个 ...

世界上没有两片完全一样的叶子,也没有两个完全相同的癌症.从根本上说,癌症是一种基因疾病,是细胞由于各种遗传因素或者后天刺激发生了突变,有一些突变改变了参与调节细胞生长和与组织环境相互作用的途径,促使细 ...

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